イスラエルとの紛争と、パレスチナ内の対立の両方が、自治区全体で住民の命と健康を危機にさらしている。ガザ地区では、イスラエルによる封鎖が続き、地区外との交流が著しく制限されている。地区内には高度医療を受けられる機関がないが、地区外の病院へ赴くことも容易ではない。また、医療従事者が地区外で研修を受けることも難しい。国境なき医師団（MSF）はガザ地区で、紛争や事故で重傷を負った人の治療、再建手術、リハビリなどを提供。またヨルダン川西岸地区では、暴力を受けたり目撃したりした人びとへの心理ケアを行っている。一方、医療従事者の研修も行い、技術の伝達に努めている。

MSFは1989年に初めてパレスチナで活動。2017年にはスタッフ147人が活動し、580万ユーロ（約7億3490万円）を支出した。