紛争が続き医療体制の整備も遅れているため、国境なき医師団（MSF）は緊急対応を続けている。人びとは激しい暴力や性暴力にさらされ、人援助団体が襲撃される事件も繰り返し起きている。MSFは暴力の被害者を治療するほか、栄養失調、マラリア、コレラの流行に対応。2018年は9回のはしかの流行に見舞われたほか、2度にわたってエボラ出血熱が発生し、この国で例を見ない規模の大流行となった。MSFは、暴力の発生や感染症の大流行などに迅速に対応できるよう、緊急チームが監視を続けている。MSFは1977年にコンゴ民主共和国で初めて活動。2018年にはスタッフ2848人が活動し、1億990万ユーロ（約143億3000万円）を支出した。